После заправки Нива стала глохнуть и плавать по оборотам. Может ли причина быть в плохом бензине?

Да, после неудачной заправки такое возможно. В обсуждении советовали проверить, не попала ли грязь в карбюратор или жиклёры, а также обратить внимание на клапан холостого хода и его уплотнение. Если проблема появилась сразу после заправки, начинать диагностику логично именно с топлива и топливной системы.